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学校肇始于1950年成立的长春市立中医进修学校，前身是1958年成立的长春中医学院，2006年更名为长春中医药大学。学校是吉林省省属重点大学、国家中西部高校基础能力建设工程高校、吉林省人民政府和国家中医药管理局共建高校、吉林省特色高水平大学建设高校。学校以中医药学科为主，医、工、管、法、文等学科协调发展，有一级学科博士后流动站2个，一级学科博士学位授权点2个，博士专业学位授权点1个，一级学科硕士学位授权点6个，硕士专业学位授权点5个。现有国家中医药管理局重点学科19个，吉林省特色高水平学科4个，省重中之重学科2个。学校设有本科专业23个，其中国家级一流专业建设点2个，国家级特色专业建设点4个，国家级专业综合改革试点专业1个。有国家级人才培养模式创新实验区1个。有国家级精品资源共享课2门，国家级精品课程3门，国家级虚拟仿真实验教学项目2项，主编规划教材40部。
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